1．畸形菇問題?；喂綄嶋H上就是由于管理不善造成的生理性病害。造成畸形菇的主要原因之一是菇棚溫度偏低，可通過提高菇棚溫度到最適生長溫度預防。因為在很低的溫度下，菇體細胞的正常分裂不能進行。原因之二就是通風管理不當造成的。通風的主要目的是為食用菌子實體的正常生長補充氧氣，同時排出其代謝廢物二氧化碳。
子實體生長分化階段對二氧化碳濃度較為敏感。如雙孢蘑菇，當菇房中的二氧化碳濃度大于1%時，往往出現菌柄長、早開傘等品質下降現象；二氧化碳濃度超過6%時，菌蓋發(fā)育受阻，菇體畸形，商品價值受損。靈芝的幼小于實體二氧化碳濃度為0.1%的環(huán)境中發(fā)育時，～般不形成菌蓋，菌柄分枝呈鹿角狀。
2．病蟲害問題。出菇期發(fā)生病蟲害尚無較好的農藥防治方法。由于食用菌生長周期短，原則上出菇期是不能使用農藥的，因極易造成農藥殘留，危害人體健康。所以，如出菇期病蟲害大發(fā)生，只能標志著栽培失敗。但對病蟲害的防治目前依然強調預防為主。主要措施是：
一是保護好菇場環(huán)境，發(fā)菌期的污染雜菌袋不能隨便丟放，更不應該扔在菇棚，要集中焚燒或挖坑深埋；通風口一定要加防蟲網，以防成蟲產卵，導致蟲害。
二是要加強通風，控制好菇棚的相對濕度。如用農藥控制，可用一些高效低毒的農藥如菊酯類殺蟲劑、多菌靈類殺真菌劑、農用抗生素類殺細菌劑，但要特別注意，絕對不能帶菇噴施農藥，而應把菇全部采凈后再使用農藥。
