一般情況下，45-55天，白色菌絲長滿整個(gè)栽培袋時(shí)，可轉(zhuǎn)入子實(shí)體階段管理，此期是決定產(chǎn)量及質(zhì)量的關(guān)鍵時(shí)期，要嚴(yán)格控制環(huán)境條件，精心管理，促進(jìn)子實(shí)體的形成和生長。這時(shí)管理中需要注意六點(diǎn)：
1．催菇。菌絲長滿培養(yǎng)料后，要使其正常出菇達(dá)到理想的產(chǎn)量和質(zhì)量，還要進(jìn)行催菇。具體方法是：搔菌、降溫和增濕。所謂搔菌就是將栽培袋口打開伸直，用消過毒的鑷子或鐵刷將接種塊去掉。經(jīng)過搔菌，子實(shí)體形成多而且整齊。經(jīng)過搔菌后，應(yīng)把溫度降到10-12℃促進(jìn)原基形成，同時(shí)要使空氣相對濕度保持在85%左右，太低不利于大量菇蕾的發(fā)生，太高會(huì)給后期病害發(fā)生帶來隱患，濕度不足時(shí)用超聲波加濕器加濕。為了更好的保濕，可在栽培袋口上覆蓋一層報(bào)紙，每天噴水2-3次。噴水要細(xì)，不能使報(bào)紙上積水，保持潮濕即可。一般經(jīng)催菇3-5天后，料面上就會(huì)出現(xiàn)大量米粒狀的菇蕾。
2．溫度控制。金針菇屬低溫型菇類，耐寒性較強(qiáng)。子實(shí)體形成和生長的溫度范圍為5-18℃，在10-15℃時(shí)對于實(shí)體形成最為有利，低于8℃時(shí)子實(shí)體生長緩慢，高于18℃時(shí)子實(shí)體很難形成。總之，金針菇適合低溫條件，在較低溫度下十出菇整齊，菌柄長，產(chǎn)量高。
所以子實(shí)體原基形成后，要嚴(yán)格控制溫度。室內(nèi)溫度最好控制在10-12℃。溫度低于8℃時(shí)，子實(shí)體生長緩慢。但菇品質(zhì)較好。溫度高于15℃時(shí)，子實(shí)體生長迅速，極易開傘形成劣質(zhì)菇?？刂茰囟仁峭ㄟ^揭蓋草苫和通風(fēng)換氣進(jìn)行的。冬季溫度很低時(shí)，可以用增溫設(shè)備，但注意煤煙等廢氣不能放到棚室內(nèi)。
為了使出菇整齊，往往還要經(jīng)過一個(gè)抑蕾或均育階段。袋栽金針菇在割袋入出菇房后，應(yīng)將溫度降至8℃2-3天，使細(xì)嫩原基迅速吹干。待原基吹干變黃后，將溫度調(diào)為12-15℃，促進(jìn)原基再生，當(dāng)再生原基形成后，將溫度控制在6-9℃至子實(shí)體采收。
